■船名における第○○の「第」は省略し、半角の英数字で表記してあります。
■鉄道建設・運輸施設整備支援機構は鉄道・運輸機構と略称で表記しています。
■出力は1PS=1.3596kw、1kw=0.7355PSで計算しています。
■市町村合併に伴う船籍地名の変更についてはこちらをご覧下さい。

船名	船種	船主or運航者	航路or備考
シーアス丸	貨物船	光洋汽船	ケミカルタンカー
シーカーゴ五島	貨物船	美咲海送	ＲＯＲＯ船
シーガル	フェリー	天草フェリーライン	２０１３年３月引退
シーガル	旅客船	木口汽船	福江〜田の浦〜奥浦
シークイーン	旅客船	九州商船	佐世保〜上五島
シーグレース	客船	早駒商事	神戸港周辺
しーぐれいす	客船	九州商船	佐世保〜上五島
シーシャトー２	客船	マリン観光開発	那覇港周辺
シーバス	客船	東京汽船	横浜駅東口〜山下公園
シーバス２	客船	東京汽船	横浜駅東口〜山下公園
シーバス３	客船	藤木企業	横浜駅東口〜山下公園
シーバス５	客船	ポートサービス	横浜駅東口〜山下公園
シーフレンド	フェリー	瀬戸内海汽船、他２社
ジーフリート	旅客船	ジール	東京湾内
シーホーク	客船	甑島商船	２０１４年３月引退　海外へ
シーマックス	客船	石崎汽船	門司〜松山
ジーラ	遊覧船	大寿海運	呼子〜鷹島
シーライン薩摩川内	客船	幸洋海運	川内〜上甑島
しいがる３	旅客船	天草観光汽船	本渡〜棚底〜御所浦
しおかぜ	旅客船	宗像市	神湊〜大島
ジェノバ�T	客船	淡路ジェノバライン	岩屋〜富島
ジェビ	旅客船	ＪＲ九州高速船	現「ビートル」
ジェビ２	旅客船	ＪＲ九州高速船	現「ビートル五世」
汐路丸	練習船	東京海洋大学
潮音	客船	東京都観光汽船	東京湾内
しきなみ	巡視艇	国土交通省	神戸海上保安部(PC-25)
8重福丸	貨物船	重福海運	タンカー
11重福丸	貨物船	重福海運	タンカー
資源	調査船	経済産業省
至幸丸	貨物船	園田海運	２０１０年９月　台湾へ
ししじま	旅客船	獅子島汽船	獅子島〜水俣
17芝浦丸	貨物船	芝浦海運	セメント運搬船
21芝浦丸	貨物船	芝浦海運	セメント運搬船
22芝浦丸	貨物船	芝浦海運	セメント運搬船
しまかぜ	取締艇	財務省
しまじ	客船	尾道ポートサービス	係船中
島鉄１号	客船	島原鉄道	島原〜三池
島鉄２号	客船	島原鉄道	島原〜三池
しまなみ	フェリー	三原観光汽船	須波〜生口島
しまなみ	客船	土生商船	予備船
1しまなみ	フェリー	しまなみ渡船	尾道（久保）〜向島（彦ノ上）
2しまなみ	フェリー	しまなみ渡船	尾道（久保）〜向島（彦ノ上）
志摩丸	フェリー	伊勢湾フェリー	０５年１月引退　タイへ
しまんと	フェリー	宿毛観光汽船	０４年１月２６日引退　海外へ
しまんと	貨物船	スミセ海運	石灰石運搬船
四万十川	フェリー	瀬戸内海汽船	広島〜呉〜松山
しもきた	巡視船	国土交通省	八戸海上保安部(PL-64)
シャトル２号	フェリー	山陽商船	０３〜０４年頃引退
シャトル３号	フェリー	山陽商船	２０１０年引退　フィリピンへ
シャトル５号	フェリー	江崎海陸運送	瀬戸〜松島
シャトルえーす	フェリー	芸備商船	２０１３年６月引退　インドネシアへ
しゃとるえーす	貨物船	近海郵船	ＲＯＲＯ船
シャトルほーぷ	フェリー	芸備商船	宇品〜三高
シャトル豊予	フェリー	国道九四フェリー	現「速なみ」
しゃるまん	客船	三原観光汽船	チャーター船
5秀栄丸	貨物船	延谷汽船	ケミカルタンカー
しゅうほう	貨物船	スミセ海運
11充山丸	貨物船	協和海運
ジュビリー	旅客船	東京都観光汽船
しゅり	貨物船	瀬野汽船	ＲＯＲＯ船
しゅれい	貨物船	琉球海運	博多・鹿児島〜沖縄〜先島
しゅれい	警備艇	内閣府	沖縄県警
純昇丸	貨物船	大川海運	ガット船
3順徳丸	貨物船	永木海運	ガット船
春風丸	観測船	気象庁	００年〜０１年頃引退
しょううん	灯台見回船	国土交通省	串木野航路標識事務所(LM-201)
しょうえい	フェリー	豊島フェリー	高松〜豊島
勝栄丸	貨物船	西田建材商会
松栄丸	貨物船	吹上工業	２０１０年９月　中国へ
翔栄丸	貨物船	豊益海漕	一般貨物船
7照栄丸	貨物船	合田汽船	オイルタンカー
23庄栄丸	曳船	米盛建設	０３〜０４年頃引退
26庄栄丸	曳船	米盛建設
51正栄丸	貨物船	正栄海運	ガット船
常栄１号	客船	豊海運	佐伯〜大入島
1じょうえい丸	貨物船	鶴見サンマリン	オイルタンカー
上越丸	タグボート	日本海曳船
昭祇丸	貨物船	昭祇汽船	ＬＰＧタンカー
昭建丸	貨物船	昭和油槽船	オイルタンカー
祥光	客船	石崎汽船	広島〜呉〜松山
5松寿丸	貨物船	松尾海運	一般貨物船
8昇辰丸	貨物船	東予汽船	一般貨物船
昭晴丸	貨物船	大洋開發	オイルタンカー
松盛丸	貨物船	松田海運	オイルタンカー
松扇丸	貨物船	松扇海運
昭仙丸	貨物船	昭和油槽船	オイルタンカー
しょうどしま丸	フェリー	小豆島高速	現「第五しょうどしま丸」
1しょうどしま丸	フェリー	四国フェリー	高松〜玉野
5しょうどしま丸	フェリー	小豆島急行フェリー	２００９年引退　フィリピンへ
7しょうどしま丸	フェリー	小豆島急行フェリー	高松〜小豆島
8しょうどしま丸	フェリー	小豆島急行フェリー	２０１２年３月引退　インドネシアへ
湘南丸	実習船	神奈川県
昭平丸	曳船	吉留海運
8照平丸	貨物船	平和海運	オイルタンカー
聖鳳丸	曳船	光和興業
昭邦丸	貨物船	昭和油槽船	オイルタンカー
3昌宝丸	貨物船	昌宝汽船	タンカー
昭裕丸	貨物船	宮崎海運	オイルタンカー
昭洋	測量船	国土交通省	海上保安庁水路部(HL-01)
翔洋丸	フェリー	石崎汽船	広島〜呉〜松山
昭洋丸	貨物船	昭洋海運	一般貨物船
18翔洋丸	貨物船	大泉物流	一般貨物船
じょうよう	清掃船	広島県清港会
しょうりゅう	タグボート	東港サービス
31昇竜丸	曳船	池畑組
正和丸	貨物船	正好汽船	２０１０年８月　マレーシアへ
昌和丸	貨物船	川内川砂利生産	ガット船
昭和丸	客船	調査中
2昭和丸	客船	調査中
白神山	貨物船	祐徳近海汽船	一般貨物船
しらいし	フェリー	白石フェリー	２０１５年３月引退
しらぎく	巡視艇	国土交通省	神戸海上保安部(CL-117)
白菊丸	貨物船	大栄汽船	ケミカルタンカー
しらきさん	フェリー	芸備商船	現「シャトルほーぷ」
白鷺	漁業取締船	水産庁	０５年３月２９日　引退
しらさぎ	貨客船	盛運汽船	宇和島〜嘉島〜能登
しらたき	フェリー	三光汽船
白萩丸	取締船	農林水産省
しらふじ丸	調査船	水産総合研究センター
2しらぬひ	フェリー	竜ヶ岳観光開発	０５年引退　海外へ
しらはま丸	フェリー	東京湾フェリー	久里浜〜金谷
紫隆丸	貨物船	小池汽船	ＲＯＲＯ船
シルバークィーン	フェリー	川崎近海汽船	八戸〜苫小牧
しれとこ	巡視船	国土交通省	前「くにがみ」(PL-65)
しろかぜ	巡視艇	国土交通省	宮崎海上保安部(CL-156)
しろちどり	実習船	三重県	三重県立水産高校
しわく１	客船	明淡高速船
しわく丸	フェリー	備讃フェリー	丸亀〜広島〜小手島〜手島
新愛徳	貨物船	誠洋汽船	一般貨物船
新永丸	曳船	高知マリンサービス
新栄丸	貨物船	宇部興産海運
5進栄丸	貨物船	進栄海運	ガット船
38真栄丸	貨物船	横須賀運油	バンカー
新栄吉丸	貨物船	第三海運	２０１０年３月　フィリピンへ
神王丸	貨物船	栗林商船	ＲＯＲＯ船
新大分丸	実習船	大分県
神加丸	貨物船	栗林商船
神海丸	実習船	島根県
新海丸	調査船	新日本海事
新鑒真	フェリー	日中国際フェリー	神戸・大阪〜上海
新旗山	貨物船	官正	一般貨物船
新吉祥	貨物船	平野海運	一般貨物船
しんぐう	旅客船	福岡県新宮町	新宮〜相島
新恵和丸	貨物船	竹下海運	一般貨物船
新賢洋丸	貨物船	パシフィック・マリタイム	セメント運搬船
しんこう	客船	岩城汽船	土生〜岩城島
しんこう２	客船	岩城汽船	貸切船
15しんこう	貨物船	赤尾汽船	オイルタンカー
進光丸	フェリー	周防灘フェリー	２０１１年１月引退　海外へ
真幸丸	貨物船	三好海運	タンカー
眞光丸	貨物船	向江海運	ガット船
10親交丸	フェリー	岩城汽船	岩城島〜赤穂根島
18新幸丸	貨物船	新岡建設海運	ガット船
35伸光丸	貨物船	伸光産業	ガット船
新さつま	貨物船	共同フェリー運輸	鹿児島〜種子島
しんざん	巡視船	国土交通省	秋田海上保安部(PS-01)
新三栄丸	貨物船	江木汽船	一般貨物船
神正	貨物船	沢原汽船	オイルタンカー
神瑞丸	貨物船	栗林商船
新世丸	曳救船	新日本海事
新世丸	貨物船	新日本石油タンカー	タンカー
神星丸	曳船	新丸菱海運
眞聖丸	貨物船	芙蓉海運	一般貨物船
新生丸	貨物船	個人所有	オイルタンカー
1新生丸	貨物船	新生海運	ケミカルタンカー
神泉丸	貨物船	泉汽船	ＲＯＲＯ
新大共丸	貨物船	大分共同海運	ガット船
新辰丸	作業船	新日本海事
新種子島丸	貨物船	里村共同汽船	鹿児島〜種子島
新潮丸	曳救船	新日本海事
新天神丸	貨物船	日伸運輸	一般貨物船
新東丸	曳押船	東広産業汽船
しんとく	練習船	航海訓練所
新なぎさ	フェリー	三洋汽船	多度津〜高見島〜佐柳島
しんぷう	漁業取締船	福岡県
シンフォニー　クラシカ	客船	シーライン東京	東京港周辺
シンフォニー　モデルナ	客船	シーライン東京	東京港周辺
10神福丸	貨物船	牧野海運	ＬＰＧタンカー
新ぷろぱん丸	貨物船	共和産業海運
しんほう丸	貨物船	塩田油槽船	オイルタンカー
新宝丸	貨物船	トヨフジ海運	自動車運搬船
5新宝丸	貨物船	島津商事	ＬＰＧタンカー
11進宝丸	貨物船	讃光海運	一般貨物船
11進宝丸	貨物船	不動海運	一般貨物船
新北王丸	貨物船	北星海運
新益栄	貨物船	益栄海運	一般貨物船
新丸岡丸	貨物船	濱本海運	ケミカルタンカー
しんみなみ丸	貨物船	日新汽船	ケミカルタンカー
神明丸	貨物船	栗林商船
新門司八号	フェリー	藤井一彦	チャーター
35神勢丸	客船	走島汽船	鞆〜走島
新洋丸	作業船	新日本海事
新洋丸	貨物船	創洋海運	オイルタンカー
神洋丸	貨物船	濱口海運	一般貨物船
2神陽丸	貨物船	山陽海運	セメント運搬船
神鷹丸	練習船	東京海洋大学
信洋丸	貨物船	東洋海運	一般貨物船
新洋丸	貨物船	新島物産	一般貨物船
進洋丸	実習船	宮崎県
新陽丸	貨物船	日新海運	一般貨物船
新力５	貨物船	不動海運	一般貨物船
新竜丸	曳救船	新日本海事
伸和丸	貨物船	伸和汽船	一般貨物船