■船名における第○○の「第」は省略し、半角の英数字で表記してあります。
■鉄道建設・運輸施設整備支援機構は鉄道・運輸機構と略称で表記しています。
■出力は1PS=1.3596kw、1kw=0.7355PSで計算しています。
■市町村合併に伴う船籍地名の変更についてはこちらをご覧下さい。

船名	船種	船主or運航者	航路or備考
ぶーげんびりあ	フェリー	鹿児島商船	山川〜根占
フィルイーズ宗谷	フェリー	東日本海フェリー
富貴８	客船	西淡路ライン	０５年３月　台湾へ
ふぇありい	客船	関門汽船	門司〜下関
ふぇありい２号	客船	関門汽船	門司港周辺
フェニックス	貨物船	春山海運	自動車運搬船
ふぇにっくす	客船	美咲海送	佐世保〜上五島・宇久〜小値賀
フェニックス　エキスプレス	フェリー	宮崎カーフェリー	宮崎〜貝塚
フェリーあがた	フェリー	九州郵船	博多〜壱岐〜対馬
フェリーあぐに	フェリー	粟国村船舶課	０２年８月引退
フェリーあけぼの	フェリー	大島運輸	０３年１月２２日引退
フェリーあずさ	フェリー	九州郵船	博多〜対馬
フェリーあそ	フェリー	九州商船	熊本〜島原
フェリーあまくさ	フェリー	島原鉄道	口之津〜鬼池
フェリーあまみ	フェリー	奄美海運	０６年４月引退　ギリシャへ
フェリーあまみ	フェリー	奄美海運	鹿児島〜喜界〜奄美
フェリー雲仙	フェリー	九州商船	００年〜０１年頃引退
フェリー11江崎	貨物船	江崎海陸運送	大瀬戸〜松島
フェリーオーシャン	フェリー	五島旅客船	福江〜奈留〜若松
フェリーおおさか	フェリー	名門大洋フェリー	大阪〜新門司
フェリー5おおすみ	フェリー	南海郵船	０２年９月３０日引退　タイへ
フェリー6おおすみ	フェリー	大隈交通ネットワーク	鹿児島〜垂水
フェリー7おおすみ	フェリー	大隈交通ネットワーク	鹿児島〜垂水
フェリー8おおすみ	フェリー	大隈交通ネットワーク	鹿児島〜垂水
フェリー10おおすみ	フェリー	大隈交通ネットワーク	鹿児島〜垂水
フェリーおおせと	フェリー	西海沿岸商船	０４年１月引退
フェリー大津島	フェリー	大津島巡航	徳山〜大津島
フェリー海龍	貨物船	有村産業	ＲＯＲＯ船
フェリーかけろま	フェリー	瀬戸内町	古仁屋〜加計呂麻島
フェリーかつらぎ	フェリー	南海フェリー	和歌山〜徳島
フェリー関釜	フェリー	関釜フェリー	下関〜釜山
フェリーきかい	フェリー	奄美海運	鹿児島〜喜界〜奄美
フェリーきたきゅうしゅう	フェリー	名門大洋フェリー	大阪〜新門司
フェリーきょうと	フェリー	名門大洋フェリー	２００２年９月引退　フィリピンへ
フェリーきょうと２	フェリー	名門大洋フェリー	新門司〜大阪
フェリーきりしま	貨物船	エイチ・アイ・エル
フェリーくちのつ	フェリー	島原鉄道	口之津〜鬼池
フェリーくまの	フェリー	南海フェリー	和歌山〜徳島
フェリーくまもと	フェリー	九州商船	熊本〜島原
フェリーくるしま	フェリー	関西汽船	松山〜小倉
フェリーけらま	フェリー	渡嘉敷村	那覇〜渡嘉敷
フェリーげんかい	フェリー	九州郵船	唐津〜壱岐
フェリーこうち	フェリー	大阪高知特急フェリー	０５年６月３０日　航路廃止
フェリーこしき	フェリー	甑島商船	現「フェリーなるしお」
フェリーごしょうら	フェリー	共同フェリー	御所浦〜与一ヶ浦・大道・棚底
フェリー五島	フェリー	九州商船	代替船（？）
フェリーさいかい	フェリー	西海沿岸商船	瀬戸〜松島〜池島〜神浦
フェリーさざん	フェリー	南海淡路ライン	泉佐野〜津名
フェリーざまみ	フェリー	座間味村	那覇〜阿嘉〜座間味
フェリーしらかば	フェリー	新日本海フェリー	敦賀〜新潟〜秋田〜苫小牧東
フェリーせっつ	フェリー	阪九フェリー	新門司〜神戸
フェリーせんしゅう	フェリー	南海淡路ライン	泉佐野〜津名
フェリーダイヤモンド	フェリー	ダイヤモンドフェリー	大分〜松山〜今治〜神戸
フェリー太陽	フェリー	鹿児島県上屋久町	種子島〜屋久島〜口永良部島
フェリーたかちほ	貨物船	マルエーフェリー	神戸〜大阪〜志布志〜沖縄
フェリーちくし	フェリー	九州郵船	博多〜壱岐〜対馬
フェリーつばさ	貨物船	大川海運物産	博多〜壱岐〜厳原〜比田勝
フェリーつるぎ	フェリー	南海フェリー	和歌山〜徳島
フェリー出島	フェリー	九州商船	０４年１２月１１日引退　東南アジアへ
フェリーとしま	フェリー	十島村	鹿児島〜十島村・名瀬
フェリー長崎	フェリー	九州商船	長崎〜五島
フェリーなは	フェリー	久米商船	那覇〜渡名喜〜兼城
フェリーなみじ	フェリー	九州商船	佐世保〜上五島
フェリーなみのうえ	フェリー	マルエーフェリー	鹿児島〜奄美〜与論〜沖縄
フェリーなるしお	フェリー	九州商船	佐世保〜宇久〜小値賀
フェリーなんきゅう	フェリー	南九船舶	指宿〜大根占
フェリーなんきゅう２	フェリー	南九船舶	指宿〜大根占
フェリーニューこしき	フェリー	甑島商船	串木野〜甑島
フェリーはやとも	フェリー	関門海峡フェリー	下関〜小倉
フェリーはやとも２	フェリー	関西汽船	小倉〜松山
フェリーひかり	貨物船	長崎運送	現「フェリーさくら」
フェリーひさか	フェリー	木口汽船	福江〜奥浦〜田の浦
フェリーひむか	フェリー	宮崎カーフェリー	宮崎〜貝塚
フェリーびんご	フェリー	備後商船	尾道〜常石
フェリー福江	フェリー	九州商船	長崎〜五島
フェリーふくおか	フェリー	名門大洋フェリー	２００２年１０月引退　フィリピンへ
フェリーふくおか２	フェリー	名門大洋フェリー	新門司〜大阪
フェリーふく彦	フェリー	関門海峡フェリー	下関〜小倉
フェリーまつしま	フェリー	松島フェリー	八代〜松島
フェリー美咲	フェリー	美咲海送	佐世保〜宇久島〜小値賀島
5フェリー美咲	貨物船	大石海運	太田和〜榎津〜小値賀
38フェリー美咲	フェリー	大石海運	佐世保〜有川
フェリーみしま	フェリー	大三島ブルーライン	今治〜大三島〜大崎上島
フェリーみしま	フェリー	崎戸商船	佐世保〜崎戸〜上五島
フェリーみすみ	フェリー	三角島原フェリー	三角〜島原
フェリー宮島	フェリー	宮島松大観光船	宮島口〜宮島
フェリーむろと	フェリー	高知シーライン	０１年１２月引退
フェリー屋久島２	フェリー	折田汽船	鹿児島〜屋久島
フェリーやまと	貨物船	大川海運物産	ＲＯＲＯ船
フェリーゆうき	貨物船	昌和建設	串木野〜甑島
フェリーれいしゅう	フェリー	安田産業汽船	０４年１１月３０日運休
フェリーロザリオ	フェリー	天長フェリー	中田〜片側〜諸浦
深江丸	練習船	神戸大学海事科学部
福井丸	貨物船	加藤海運	一般貨物船
ふくえ	警備艇	内閣府	長崎県警
ふくえ	巡視船	国土交通省	五島海上保安署(PM-22)
8福栄丸	貨物船	個人所有	一般貨物船
福元丸	貨物船	東洋汽船	ガット船
福祥丸	貨物船	個人所有	一般貨物船
18福昌丸	貨物船	丸兼石材	ガット船
2福神丸	貨物船	房州物流	ガット船
15福神丸	貨物船	福神海運建設	ガット船
福久丸	貨物船	福久海運	一般貨物船
福豊丸	貨物船	福田海運	タンカー
88福丸	起重機船	植村組
ふくやま丸	フェリー	せとうち物流	２００１年８月引退
福吉号	貨物船	ヤマイチ建設	ガット船
5福吉丸	貨物船	個人所有	一般貨物船
11福吉丸	貨物船	浜崎汽船	一般貨物船
1福和丸	貨物船	大坪組	ガット船
5福和丸	貨物船	大同海運	ガット船
8福和丸	貨物船	大同海運	ガット船
ふじたか	客船	藤井一彦氏
ふじまりん	貨物船	フジトランスコーポレーション
冨士丸	貨物船	共同フェリー運輸	２０００年５月引退
富士丸	貨物船	霧島物流	セメント運搬船
ふじ丸	客船	商船三井客船
2富士丸	曳船	個人所有
2ふじ丸	バンカー	調査中
不捨丸	曳船	近藤海事
ふよう	巡視艇	国土交通省	福岡海上保安部(CL-122)
1芙蓉丸	貨物船	芙蓉海運
フラワーのこ	フェリー	福岡市	姪浜〜能古島
フラワーマーメイド	客船	志摩マリンレジャー	鳥羽周辺
フラワーライン	フェリー	名鉄海上観光船	師崎〜伊良湖
ぷりんす	客船	三洋汽船	笠岡〜白石島〜真鍋島
2ぷりんす丸	貨物船	プリンス海運	自動車専用船
ぷりんせす　おきなわ	フェリー	琉球海運	２０００年１月引退　韓国へ
プリンセスオリーブ	客船	両備運輸	岡山〜小豆島
プリンセスのうみ	フェリー	江田島市	宇品〜中町
プリンセスわかさ	フェリー	コスモライン	鹿児島〜種子島
ブルーオーシャン	客船	不明
ブルーシャトル	客船	宮島松大観光船	宮島口〜宮島？
ぶるーすかい	客船	久米商船	那覇〜渡名喜〜真泊
ブルーダイヤモンド	フェリー	ダイヤモンドフェリー	０８年２月７日引退　海外へ
古鷹	フェリー	瀬戸内海汽船	呉〜小用
ブルーバード	客船	四国汽船?
ブルーライナー	客船	天草観光汽船	八代〜本渡
ブルーライナー２	客船	天草観光汽船	八代〜本渡
ブルーライン	フェリー	内海フェリー	高松〜小豆島
ブルーライン１号	客船	大三島ブルーライン	今治〜大三島〜大崎上島
3ぶんご	曳船	中津留組
5ぶんご	曳船	中津留組
豊後丸	貨物船	大分海運	セメント運搬船
10文章丸	貨物船	やまは工業	ガット船